一篇论文投到SCI杂志后，editor（或Managing Editor、associate editor,甚至是editor in chief）会对稿件做出一个初步的意见或结论。第一，判断论文的内容是否符合期刊的定位或scope,如果不符合收稿要求，编辑就不用再浪费时间了，不用外审了，直接退稿，当然退稿信会简单解释原因，但都应该是通用格式。遇到这种情况：就是再找一个合适的期刊，再投。
2．如果论文投稿符合SCI杂志的收稿要求，接下来editor就会看下面两个问题：①论文手稿是否完整，有没有缺少某些部分，比如图和表； ②手稿的格式是否符合期刊的基本格式。上面两个问题如果有一条不符合，,论文也会立马退回，绝大多数期刊的editor都不会让审稿人去浪费时间去审阅明显有上述问题的稿件。
上面两条通过后（当然有些稿源丰富的期刊还会由作为大同行的编辑对稿件的内容本身，尤其是创新性进行评估），下面editor要干的活的就是找合适的审稿人（一般是两个）进行外审。
两位同行的评审意见收到后，接下来editor要做的工作是：比如两位审稿人都建议接受（accept），并且都有很强的理由，论文只需小修甚至无需修改，这种情况下editor要做的决定是显而易见的。但如果问题变复杂了，例如，很多情况下，两个审稿的意见是不一致的，甚至是完全相反的，或者其对稿件的推荐意见并没有很强的证据说明，这种情况下,editor有两种选择：或做最后决定，或再找一个或更多地审稿人继续审，看是否能有一致的评审意见。如果editor对文章的内容可以说是大同行(reasonably expert in the subject area of the manuscript)，此时他/她就可以作为第三个审稿人做出自己的判断，editor很可能会如此做，尤其是当其中一个审稿人的意见比另外一个明显更有说服力的时候。第二个选择：再送外审，显然需要花更长的时间，比较弱的编辑往往会如此选择。但是这第二个选择，任何editor都一定要如此行的，尤其是对论文的内容自己不熟悉的时候。
外审结束，editor也做出决定后，此时作者就会收到editor的通知(现在几乎都用email了),注意：这是editor的最后决定，审稿人或者editorial Board members只对文章是否录用做出推荐意见，最后的决定是而且一定是由editor(当然这活有时是由associate editor, editor in chief来干的) 做出的，尤其是对于采取匿名审稿方式的期刊，更是如此。
一般而言，editor的决定由三中类型：”accept’, “reject”, “modify”。上述决定一般在文章投稿后4-6周内都能搞定。如果您在投稿8周后，还没有收到editor的最后决定（或者解释稿件耽搁的理由），此时，就不要再犹豫，赶快和editor联系。作为作者，我们有权利在合理的时间内(4-6周)知道稿件的命运，或者至少知道论文的进展情况。上述时间问题尤其重要，经常有人问：“文章已经投了X(X=个位数)天，还没有消息，是否该问问了”。8个周或者说两个月是一个很重要的参考时间。事实上，editor的办事效率估计永远也满足不了投稿的作者的需要或者说期望值。