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如何将rnaseq数据如代谢组学数据整合

今天小编给大家带来的是如何将rnaseq数据如代谢组学数据整合,希望能帮助到大家!
工具/原料
1

rnaseq

2

数据

方法/步骤
1

将rnaseq数据如代谢组学数据整合就是把mRNARNA-seq即转录组测序技术。

2

反映出它们的表达水平,smallRNA,and NONcoding RNA等或者其中一些用高通量测序技术把它们的序列测出来。

3

参考序列的长度,原则上越接近原基因长度越好;参考序列的数目,若数目太少,大量tag比对不上基因,用来分析的基因就会减少,得到的信息就会减少。

4

另外,参考序列冗余,会导致很多信息丢失。

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对目前不清楚的物种,没有太多可用的参考序列,选取时要慎重,总之cDNA好于CDS,CDS好于EST。

注意事项
1

网络虽好,但要注意劳逸结合哦!

2

如果是青少年,小编在这里提示大家千万不能沉迷网络!

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