HE染色液
苏木素是碱性染料，蓝紫色，可以使细胞核等着色。被苏木素着色的结构本身为酸性，具有嗜碱性；
伊红是酸性染料，粉红色。可以将大多数细胞的细胞质染成红色。被伊红着色的结构本身为碱性，具有嗜酸性；
不易被苏木素和伊红着色的结构具有嗜中性。
样品处理：a.对于石蜡切片:二甲苯中脱蜡5-10分钟;换用新鲜的二甲苯，再脱蜡5-10分钟;无水乙醇5分钟;90%乙醇2分;70%乙醇2分钟;蒸馏水2分钟.b.对于冰冻切片：蒸馏水2分钟。c 对于培养细胞：用4%多聚甲醛固定10分钟以上。蒸馏水洗涤2分钟。换用新鲜的蒸馏水，再洗涤2分钟。
苏木素伊红(HE)染色对于上述处理好的样品：苏木素染色液染色5-10分钟(可以根据染色结果和要求调整时间)。浸自来水中冲洗去多余的染色液，约10分钟。蒸馏水再洗涤一遍(数秒钟)。95%乙醇5秒。伊红染色液染色30秒-2分钟(可以根据染色结果和要求调整时间)。此时，如果需要直接观察，可以用70%乙醇洗涤2次。如需脱水、透明后封片按后续步骤进行，70%乙醇洗涤后仍可按照后续步骤进行脱水、透明和封片处理。
3. 脱水、透明、封片或进行其它染色a) 脱水、透明、封片：95%乙醇脱水2分钟。换用新鲜的95%乙醇再脱水2分钟。二甲苯透明5分钟。换用新鲜的二甲苯，再透明5分钟。用中性树胶或其它封片剂封片。显微镜下观察，细胞核呈蓝色，而细胞浆呈粉红色或红色。b) 进行其它染色：如果进行免疫荧光染色，或进行Hoechst等荧光染料的染色，在伊红染色液染色后：70%乙醇洗涤2次，每次2分钟。PBS或生理盐水或TBS或TBST等用于免疫染色或荧光染料染色的溶液浸泡5分钟。然后就可以进行免疫荧光染色或其它荧光染料的染色了。
显微镜下拍照，进行结果分析。
判断免疫染色切片是否合格；
可用计算机系统处理并分析图片；