全长转录组研究是理解生物机体功能的一个重要途径。传统二代转录组测序无法直接获得单个RNA分子由5ˊ到3ˊ的全部序列。基于PacBio三代测序平台的转录组研究，无需打断，直接读取反转录的全长cDNA,能够有效的获取高质量的单个RNA分子的全部序列，准确辨别二代测序无法识别的同源异构体（isoform）、同源基因、超家族基因或等位基因表达的转录本。
工具/原料
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三代测序仪：Pacbio RSⅡ 或 Pacbio Sequel
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RNA抽提试剂盒
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建库试剂盒
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全长转录组分析的软件
方法/步骤
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一、技术流程
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二、生物信息分析内容 1. 测序质量分析与统计、评估；全长序列判断，高质量Isoform（QV>99%）； 2. 参考基因组比对； 3. 新转录本预测； 4. 基因表达定量分析、基因表达水平分析； 5. 差异基因表达分析、差异表达基因GO富集分析和Pathway富集分析； 6. SNP和Indel分析； 7. 转录本结构分析：可变剪切分析；融合基因分析。
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三、结果展示 1.数据库使用 基因表达量分析 KEGG Pathway 2.版图展示 如图1.1所示，可变剪切事件分类和表达量统计；
注意事项
样本要求：总量〉4 µg RNA；浓度〉50 ng/µL；260/280〉2.0
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