DAVID在GO和KEGG富集分析中的应用

DAVID网址：https://david-d.ncifcrf.gov/

Gene名称必须是office gene symbol

在这里我们选取CGC中的gene作为演示，这里Gene以列表形式出现（如下图所示），需要注意的是Gene名称必须是office gene symbol，不能是别名。

接下来我们正式开始富集分析了，打开网址https://david-d.ncifcrf.gov/，6.7版本（虽然有6.8版，但是实验室的人觉得6.7的好用，所以这里还是用6.7版），界面如下所示，点击Start Aanlysis。

DAVID具体使用流程如下图所示，（1）首先把Gene列表输入到list中；（2）选择office gene symbol；（3）选择Gene list；（4）Submit list。

完成以上四步就完成了提交，这时网页需要反应一会后，会弹出以下对话框，点击确定即可。

接下来就出现如下图所示的界面，按照按照流程选择（1）选择物种，这里选择的是人类的；（2）选择list；（3）点击Functional Annotation Chart，这里要反应一会儿。

进入下一个界面，如下图所示，首先把所有默认选项都清空，只选择Gene_Ontology下的GOTERM_BP_DIRECT和Pathways 下的KEGG_PATHWAY  ，最后点击 Functional Annotation Table。

这时结果就都出来了，大家可以根据自己的需要选择是否下载分析结果，点击右上角的Download File就可以下载了。