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全血RNA提取方法及步骤

红细胞裂解液选择性裂解红细胞,然后独特的裂解液/β-巯基乙醇迅速裂解白细胞和灭活细胞RNA酶,然后用乙醇调节结合条件后,RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜, 再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的RNase free H20将纯净RNA从硅基质膜上洗脱。
工具/原料
1

转速可以达到13,000 rpm的传统台式离心机

2

乙醇,β-巯基乙醇

方法/步骤
1

第一次使用前请先在漂洗液RW瓶和70%乙醇瓶中加入指定量无水乙醇!使用前将10X红细胞裂解液RLB用DEPC处理水稀释到1X。操作前在裂解液RLT中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1 ml RLT 中加入10μl β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的RLT 4℃可放置一个月。在适合大小的RNase free离心管中加入1体积(<1.5 ml)加入各种抗凝剂新鲜血液 (颠倒混匀后)和3体积的红细胞裂解液RLB,颠倒混匀,可轻弹管壁,确保混匀。

2

室温放置10分钟(期间应该颠倒轻弹混匀数次帮助裂解红细胞)。    如果RNA降解严重,可在冰上裂解,但是时间可长一些以充分裂解。

3

12,000 rpm离心20秒,倒弃红色上清,并小心的尽可能多的吸弃上清(注意不要吸到管底的细胞团),留下完整的管底白细胞团。    离心后在管底应该见到白色的白细胞团,也可能有一些红细胞残片和白细胞团在 一起,但是如果看到的是大部分的红色细胞团,说明红细胞裂解很不充分,应该再加入红细胞裂解液重悬细胞团后重复步骤2,3。    上清尽可能的吸弃,残留过多会稀释裂解液,造成裂解结合异常,产量纯度降低。

4

涡旋或者轻弹管壁将白细胞沉淀完全松散重悬,加入350μl(<0.5 ml全血)或者600μl(0.5-1.5ml全血)裂解液RLT,吹打混匀后用手剧烈振荡20秒,充分裂解。病人正常血样白细胞数量为4000-7000/μl,如果血样中白细胞数量可能大幅增加,应该适当减少处理量。或者按照350μl(<2x106白细胞)或者600μl(2x106-1x107白细胞)比例加RTL。

5

用吸头吹打混匀帮助裂解或者剧烈涡旋震荡直到得到满意匀浆结果(或者电动匀浆30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高产量。

6

较精确估计裂解物体积,加入等体积的70%乙醇(请先检查是否已加入无水乙醇!),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。

7

立刻将混合物(每次小于700μl,多可以分两次加入)加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm离心60秒,弃掉废液。

8

加700μl 去蛋白液RW1,室温放置1分钟,12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。

9

加入500μl漂洗液RW(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。加入500μl漂洗液RW,重复一遍。

10

将吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

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取出吸附柱RA,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50μl RNase free water(事先在 70-80℃水浴中加热效果更好), 室温放置1分钟,12,000 rpm 离心1分钟。

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如果提取全血>0.5 ml或者>2x106白细胞,加30-50μl RNase free water重复步骤11,可以得到更多的RNA,或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍(如果需要RNA浓度高)。洗脱两遍的RNA洗脱液浓度高,分两次洗脱后如果合并洗脱液的RNA产量比前者高15–30%,但是浓度要低,用户根据需要选择。

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关于DNA 的微量残留:一般说来任何总RNA提取试剂在提取过程中无法完全避免DNA的微量残留,EASYspin系列RNA提取产品,由于采取了独特的缓冲体系和选择了特殊吸附能力的吸附膜,在大多数RT-PCR 扩增过程中极其微量的DNA残留影响不是很大,如果要进行严格的mRNA表达量分析如荧光定量PCR,我们建议在进行模板和引物的选择时:(1)       选用跨内含子的引物,以穿过mRNA中的连接区,这样DNA就不能作为模板参与扩增反应。或者选择基因组DNA和cDNA上扩增的产物大小不一样的引物对。缩短延伸时间,使DNA来源模板无法参与扩增反应。(2)       将RNA提取物用RNase-free的DNase I 处理。在步骤去蛋白液RW1漂洗前,直接在吸附柱RA上进行DNase I处理

14

附录1:DNA酶柱上消化(详细请参考RN34 DNase I 柱上消化试剂盒说明书)1.        按照前面所列RN06试剂盒操作步骤操作,直到做完操作步骤7。2.        取45μl DNase I buffer和5μl RNase free DNase I在离心管轻轻吹打混匀成工作液(处理多个离心柱子要按照比例放大制备工作液)。3.        向吸附柱RA 中加入350μl去蛋白液RW1,12,000 rpm 离心30 秒,弃废液,将吸附柱放回收集管中。试剂盒来源:昊鑫生 物。4.        向吸附柱RA 中央加入50μl的DNase I 工作液,室温(20℃-30℃)放置15 分钟。注意直接将工作液滴在膜中央上向膜四周浸润充分和膜接触,不要让工作液滴在O型垫圈或是离心柱管壁上挂壁或者挂在垫圈上不能充分和膜接触。5.        向吸附柱RA 中加入350μl去蛋白液RW1, 12,000 rpm 离心30-60 秒,弃废液,将吸附柱放回收集管中。接操作步骤9完成后续步骤。

注意事项
1

所有的溶液应该是澄清的,如果环境温度低时溶液可能形成沉淀,此时不应该直接使用,可在37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清。

2

不合适的储存于低温(4℃或者-20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室温下(15℃-25℃)进行。

3

避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

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