祠堂留下的信息是多方面的，如何保留先人遗留的历史印迹，使之永远传承。是我们在修缮、保护中值得注意的问题，具体操作应从以下几个方面着手。
第三次全国文物普查不可移动文物认定标准中规定：实际存在，具有历史、艺术、科学价值的不可移动历史文化遗存，均应认定为不可移动文物。祠堂古建筑具有如下条件之一的予以认定：
1、建筑物、构筑物主体存在；2、建筑物本体重修，但原有风格或形置基本保留；3、建筑物整体迁移，在新迁址占有独立地域范围。
整体搬迁后，在新址有独立的地域范围，所以继续保留其市级文物保护单位地位。在祠堂修缮前，一定认真做好认定工作，以利于祠堂建筑申报文物保护单位，最好请文物管理委员会的专家帮助认定。
修缮古祠堂建筑，做好维修方案只能保证质量的30％，真正要做好，70％在施工。比如材料的选择、加工；原构件的拆卸、保护、复原、安装，都是施工过程中的问题。
从目前的祠堂建筑来看，本地区的大多为明、清样式。在修缮过程中，要认清祠堂建筑是明式还是清式的。明清祠堂建筑从形态上看基本上是相同的。布局均采用路进式；建筑结构都是传统的木构架，有抬梁式和穿斗式，还有抬梁、穿斗混用的；从色彩上看，都是粉墙黛瓦，黑白两色。
首先，从体量上看，明式比较偏矮偏小，清式偏高偏大。其次，从屋面上看，明代建筑比较舒缓，有明显的弧度，清代建筑则比较陡直。屋面有弧度的做法叫'提栈'又称'举折'始于宋代，明代比较普遍。
从柱础上看，明代多用木鼓礅，少用青石鼓礅。青石鼓礅一般带都有雕刻，内容多见花卉，线条简洁流畅，手法饱满圆润。俗称'青石价沿木鼓礅'就是典型的明代做法。清代多用石鼓礅，材质大多为花岗石，以素面为主，少雕刻。
从柱础上看，明代多用木鼓礅，少用青石鼓礅。青石鼓礅一般带都有雕刻，内容多见花卉，线条简洁流畅，手法饱满圆润。俗称'青石价沿木鼓礅'就是典型的明代做法。清代多用石鼓礅，材质大多为花岗石，以素面为主，少雕刻。
从梁架上看，明代一般不用山雾云，要用也比较简洁。清代则多用山雾云，并且大而繁。
从墙体砌筑方法上看，明代一般为实砌，且多用叠涩砌法。梢间山墙内侧，一般贴有砖细墙裙。清代有实砌，有空斗，也有下实上空混合砌法，但未见有叠涩砌筑的做法，也很少使用砖细墙裙。
从梁枋、门窗雕刻风格上看，明代简洁流畅，饱满圆润，富有动感。清代繁琐，程式化，缺乏生气。灰塑水作的风格与木作基本一致。
祠堂建筑的'三雕'即木雕、砖雕、石雕，有负载传达信息的任务，有劝谕、认知、教化的作用。明清两代的'三雕'达到了'图必有意，意必吉祥'的程度。
祠堂建筑在修缮过程中，要尽最大努力去考察、研究。认清了祠堂建筑的自身特点，在建筑面前保持谨慎的头脑，十分细心地对待，尽可能把它们的原状--历史的、科学的、文化的、社会的特点保存下来，流传下去。这样才能把修缮工作做好。
在祠堂功能和布置上，应在传承民俗习惯的基础上有所创新。
祠堂里比较重要的活动区域是最后一进的享堂，是用来摆放神位进行集体祭祀的地方。进入享堂就可以看见堂屋中央放着的神龛，神龛被分为两部分，中间是神位，两侧是祖板。神位一般是用木头制成的长方形立碑，立碑下面有基座，中间写着'天地国亲师'等神的称号，上面一般装饰以精美的木质雕龙。
祠堂已经成为宗族的主要标志之一，它的功能首先是供奉神灵和死去祖先的牌位，成为祭祀祖先的场所，它不仅表达了人们对同一祖先的认同和纪念，墙上的祖训、家规还使人们的行为在一定仪式的基础上形成规范，所以祠堂的兴建还表明人们表达其宗族观念的行为模式进一步系统化和规范化。
伴随着人口的繁衍和宗族组织的扩大，祠堂的功能化。祠堂不仅成为宗族祭祀和聚会的场地，还让同一宗族的成员产生家族和血缘认同，并且起到传授宗族知识、规范成员行为、调节人际关系和经济互助的作用，因此祠堂的功能，不只是祭祀，还有社交、娱乐、教育、裁判、外交等事宜，也归于祠堂行使职权。
现代的祠堂布置，不光应该追求建筑的高大雄伟、富丽堂皇，更应注重宗族文化的挖掘，为此家谱国际专门提出一套解决方案，花巨资打造一台查谱一体机配合家族祠堂软装方便家族文化的传承。
祠堂建筑公布为文物保护单位后，做好'四有'工作是保护好祠堂的基本工作。
四有'即有划定的保护范围、有标志说明、有记录档案、有保护的专门机构或人员。
建立记录档案，是对祠堂建筑所做的重要基础性工作。记录档案应当包括祠堂建筑本体记录等科学技术资料和有关文献记载、行政管理等内容。要充分利用文字、音像制品、图画、拓片、摹本、电子文本等到形式，有效表现其所载内容。
做好祠堂建筑的'四有'工作，是对祠堂建筑科学管理最为有效的办法，我们应当本着对历史负责、对子孙后代负责的精神，做好祠堂建筑的'四有'工作。