介绍如何用EcoSim软件计算C-score值,从而判断Community是随机分布还是Co-occurrence
工具/原料
EcoSim软件
方法/步骤
1
File菜单--Open,载入数据(0,1表示是否存在)
2
Analysis菜单--Co-occurrence
3
如图设置参数,选择C-Score指数
4
设置运算次数(越大越准确,但是耗时越长)
5
运算结果如图,可以将结果保存为文本文件
注意事项
原始数据必须用0和1表示
EcoSim软件
File菜单--Open,载入数据(0,1表示是否存在)
Analysis菜单--Co-occurrence
如图设置参数,选择C-Score指数
设置运算次数(越大越准确,但是耗时越长)
运算结果如图,可以将结果保存为文本文件
原始数据必须用0和1表示