今天继续介绍如何利用Image J软件,非手绘方式来确定细胞划痕实验的面积。
工具/原料
1
Image J软件
2
细胞划痕实验图片
方法/步骤
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同样点击Image J软件并安装好,如图所示。
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点击file和open,将细胞划痕实验结果图导入。
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点击Image,下拉点击Type,换成8-bit。(此为背景转换)
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点击Process下拉第三个为Find Edges,点击Find Edges。
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点击Process,再点击Sharpen,此步骤起到加强对比的作用。
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点击Image,下拉点击Adjust,然后再点击Threshold。弹出如图所示对话框。
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将弹出的对话框里的Default的red改成B&W,就是黑白。
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然后将Default此框上方,数值显示12,把它改一下。改成的标准以划痕中间值出现零星白点为最好。这里改成19。本文中的划痕图片结果不太好,看起来细胞和中间的划痕界限不是很明显。然后点击set,确定就可以了。
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接着重复步骤4,继续点击Process,然后点击Find Edges,如图所示:
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然后叉掉Threshold对话框,然后点击analyze,点击analyze particles。
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将size pixel的0-infinity改成10000-infinity,然后将Display results 以及summarize还有add to manager都打上勾。将clear results叉掉。然后将show的nothing改成outlines。完成所有步骤后点击ok即可。Area显示,23022.
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