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运用KEGG数据库查询某个基因注释到哪些通路

在医药学领域,我们要查询基因都在哪些通路中,可以从KEGG庞大的数据库中快速寻找我们想要的信息。下面介绍一种实用的方法。
工具/原料
1

能正常上网的电脑

2

基因名称

方法/步骤
1

首先打开KEGG搜索界面,如下图。

2

Search against输入'hsa',PrimaryID 类型选择“NCBI-GeneID”,在“Enter objects one per line followed by bgcolor, fgcolor”下方文本框中输入要查询的基因名“GPX1”。

3

在“Examples”下方选择“人”的通路。

4

点击“Exec”,弹出查询到的通路。

5

点击其中任何一个通路,弹出通路图界面。

6

其中的红色块即为该基因或该基因相关的基因。点击红色块,弹出界面可以查看详细的信息。

注意事项

也可以查询一些基因注释到哪些通路,方法类似。

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