多语言展示
当前在线:506今日阅读:23今日分享:25

三代测序(全基因组denovo)

动植物基因组denovo测序基因Pacbio 单分子实时测序技术,对动植物基因组进行Pacbio 测序及拼接组装(纯三代组装),较好解决了传统测序组装技术难以解决的高杂合度、高度重复区域、异常GC含量区域等诸多组装难题,极大提升大基因组的组装指标,重新定义Contig N50、Scaffold N50指标——采用纯三代组装的基因组组装指标,是过去二代测序策略的10-20倍。
工具/原料
1

样本抽提DNA/RNA试剂盒

2

建库试剂盒

3

三代测序仪:Pacbio RSⅡ 或 Pacbio Sequel

4

组装分析软件:Falcon

方法/步骤
1

一、技术路线

2

二、生物信息分析 1. 原始数据质量评估       2. 基因组组装       3. 基因组注释       4. 进化分析       5. 重测序或转录组联合分析

3

三、结果展示       1.软件使用    FALCON     HGAP(Hierachical Genome Assmebly Process)             2. 版图展示       图1.1所示,全基因组拼装后预测重复序列;

注意事项

样品要求: DNA总量〉10 µg;浓度〉20 ng/µL;260/280为1.8~2.2

推荐信息