精心挑选饱满成熟的豆子：生芽苗菜对豆子的要求是比较高的，必须是饱满的豆子，成熟的豆子，如果豆子不成熟，或者不饱满，干瘪，生芽苗菜的时候就会造成无法发芽的情况，接着就成了坏的豆子，有了坏的豆子，就容易影响到其它的豆子腐烂，腐烂了就容易出现小飞虫了，所以一定要选择饱满成熟的豆子。
浸泡豆子筛选烂豆或干瘪豆：自己用肉眼精心选择饱满成熟的豆子后，如果不放心，感觉还有烂豆或不好的豆子，可以把豆子放入清水中，需要把所有的豆子彻底浸没，然后把浮起来的豆子全部用笊篱捞出去扔掉，浮起来的豆子是无法生芽苗菜的，并且这些豆子会影响到其它的豆子，导致出现小飞虫。
控制好芽苗菜的冲水量做好排水工作过去农村生芽苗菜都是选择瓦缸，并且瓦缸的底部必须有一个排水孔，这样是给豆子浇水，俗称冲豆芽，豆子是不能在水里浸泡的，冲水仅仅是为了保持豆子生长所需的水分，保持湿度；现在都是种植芽苗菜了，但依然要控制好芽苗菜的冲水量，并且要冲水均匀，最好使用喷壶，并且要做好排水工作，芽苗菜内不能有积水，防止烂根，才能防止出现小飞虫。
每天要多次给豆子浇水保持湿度：豆芽菜是不能缺水的，必须保持做够的水分或湿度才能更好地发芽生长，每三个小时就需要浇一次水，并且要在豆子的上面盖上一个棉白布，吸水性好一点，厚一点的棉白布上方还要压一块石头，这样可以让豆芽长得粗壮一点。同时盖上棉白布是为了干净并保持湿度，湿度要保持80%，如果湿度不够造成烂根也会出现小飞虫。
冲豆子的水必须是干净的不沾油的水：记得小时候，在冲豆子生芽苗菜的时候，使用的水都是刚刚从水笼头接的地下水，不能使用温水，必须是凉水，还不允许用口去喝，说自己刚吃过饭，嘴上有油，沾油的水是不能冲豆子的，不然豆子就烂掉了，看来是有道理的，所以冲豆子的水一定要用凉水并且不能沾染油性。不过，现在才知道那个时候是为了省煤，才不适用温水的，温水还是比较好的，会让芽苗菜长得更快。
豆子要放在阴凉处要避光控制好温度：芽苗菜在生长的过程中必须一直在阴凉的通风处，不能见光，更不能被阳光晒到照射到，要控制好温度，一般是25度左右，温度太高，会烂根，现在想想，应该是温度不能太高，必须保证湿度，见到阳光会影响发芽或芽的生长，并且要每天观察豆芽的生长，当然不要直接用手去触碰抓或翻这些刚刚发芽的小豆苗。
及时食用不要生长的太长：芽苗菜最好在根部还没有长出很多毛细根的时候就食用，不要让芽苗菜长得太长，太长了，会影响口感，同样颜色会改变，长得太长，如果食用或销售不完的话，人一直在豆芽中倒翻，就会改变豆芽的温度，导致温度增高，接着就是容易烂根了，出现小飞虫的情况。
保证芽苗菜的生长环境卫生：生芽苗菜或种植芽苗菜都需要一个干净无菌的卫生环境，所以要保证芽苗菜生长的环境干净，每天要进行适当的通风，尤其是炎热的夏季，要强制通风，同时要喷水进行降温，一波的芽苗菜出售完毕后，要及时地做好消毒工作，这样才能避免芽苗菜感染病菌，或出现烂根情况，出现小飞虫。