2、种晶合成水晶中可见种晶板。种晶板即从天然水晶上切下呈板状晶体作为种晶，故称为“种晶板”。种晶板有无色、彩色两种。种晶板与后期生长晶体之间有清楚的界限和颜色差异。受高压釜内过饱和溶液或釜内温度波动的影响，一些杂质或自发形成的微晶粒落在种晶板的晶面上或有缺陷的部位，形成微小的花絮状双晶，在显微观察中双晶表面为灰白色雾状。种晶板的附近还常出现十分细小的应力裂纹，裂隙面呈弯折状，与种晶板成一定夹角排列。
3、包裹体特征包裹体又称为宝石矿物的内含物。水晶包裹体品种繁多，可谓是“一个奇妙的矿物世界，丰富多彩的矿物博物馆”。所以在鉴别水晶时，关键是看水晶的包裹体。在合成水晶中主要出现的是锥辉石，或石英的微晶核，呈面包渣状。它们可能来源于那些未溶解的原料，当合成水晶生长条件较稳定时，“面包渣”就十分稀少，当生长条件不稳定时，特别是在合成水晶生长阶段发生中断时，在平行于种晶板的一些平面内“面包渣”大量出现，犹如“桌面灰尘”，一层甚至两、三层贯穿于整个晶体中。初学者常把这些“面包渣”或“桌面灰尘”当成天然水晶的证据。如果在高倍显微镜下仔细观察，天然水晶的“面包渣”多为细小的气液两相包裹体，而合成水晶的“面包渣”则为均一细小雏晶。
4、色带合成紫晶与合成黄水晶中可出现色带，但仅出现一组色带，色带平行于种晶板。所谓色带是指晶体内具有条带状颜色。合成紫晶的色带平行于菱面体方向，合成黄水晶是垂直于晶体光轴的平行色带。
5、双晶双晶是两个或两个以上的同种晶体按一定的对称规律形成的规则连生在一起。天然水晶中常出现巴西律聚片双晶，双晶可以贯穿整个晶体，也可能仅表现在晶体的局部。在天然水晶中非双晶区域可显示牛眼干涉图，而在双晶区域可显示“螺旋桨”状干涉图，而合成水晶中，一般可见牛眼干涉图，而看不到“螺旋桨”干涉图。
①合成水晶多采用残次的水晶渣、玻璃渣熔炼，经过磨光加工、着色仿造而成，没有均匀条纹、柳絮状物质。天然水晶在形成过程中，往往受环境影响总会有一些杂质，对着太阳观察时，可以看到淡淡均匀细小的横纹或柳絮状物质。
②合成水晶没有凉爽的感觉。天然水晶在炎热夏季的三伏天，用舌头舔天然水晶表面，也有冷而凉爽的感觉。
③合成水晶竖放在太阳光下，无论从哪个角度看它，都能放出美丽的光彩。
④合成水晶用碎石在上面划会留下痕迹。天然水晶硬度大，用碎石在饰品上轻轻划一下，不会留痕迹;
⑤用偏光镜检查合成紫水晶没有有二色性
⑥用放大镜检查：用十倍放大镜在透射光下检查，合成能找到气泡。
⑦用头发丝检查：将水晶放在一根头发丝上，人眼透过水晶能看到头发丝双影的，则为天然水