代表黑白两道的卓惊风和慕容断秋，在一次偶然的机会上来到了云梦泽东部的穷奇洞。 二人本想合力打败穷奇，没想到却慕容夫人被误伤，用尽了方法也没有醒过来，慕容断秋誓为妻子报仇，于是黑白两道再起纷争。 …… 十年后，盘龙山庄。 这天苏远山收到了师傅道罡的任务，于是带着小师妹莫茗下山解救袁成威，并解除威远镖局的困境。 二人来到营地，进入主帐。
第二天清晨，为了解决危机，二人前往鬼哭林击败裘万仇。 裘万仇就在林子的东北面，击败裘万仇后回到袁成威的主帐。 二人在路上听到猎户求救的声音，为了帮助猎户，要去找师傅问问解药的问题。找到师傅后，要去向药童（聚义山庄东南角）打听鬼医的下落。原来鬼医去云梦泽采药去了，其实鬼医就在云梦泽北部。10个毒蛛延和10块虎蛟骨（商店都能买到）。获得驱魔幡（支线）
回到主帐，二人因鬼哭林一战而扬名江湖。 这天，任家的人来寻求帮助，任老二看不起二人，并要和二人切磋。 打败任老二后，二人则是前往聚义山庄。 出了主帐，就一直往西，到了云梦泽中，也要一直往西。 二人终于来到聚义山庄。
来到聚义山庄，出了任家兄弟外，也认识了卓惊风。 卓惊风一直因为当年的事情耿耿于怀，于是将信交给苏远山，让他交给慕容断秋。 穿过石镇前往黑道送信。来到聚义山庄外围，向南走。 进入石阵深处，被玄阴道人叫住。
一句话都没说就开打。 打败道人后，就跟着她去见慕容断秋。 将信交给慕容断秋，慕容为了自己的妻子，迟迟不肯让步。 于是为了让慕容让步，二人要得到穷奇的心脏，将慕容的妻子救星。 穷奇洞在云梦泽东。 终于来到了穷奇洞。
二人进入洞中后，莫茗不听话的直接冲进了深处。 这时候就听到莫茗的参加，苏远山也快步来到深处。 来到穷奇洞内部，看到穷奇威胁着莫茗的生命。
二人合力打败穷奇兽。于是带着穷奇的心脏回到黑道营地。 莫容的妻子因为穷奇的心脏而醒了过来，正要离开。 就听说在山庄西边有结界，并且出现了很多怪物。 于是二人回到聚义山庄西边调查。 二人来到结界深处，看到了师傅道罡。
原来师傅的身体被妖怪所控制，为了维护世界的和平。 二人只能选择大义灭亲。 就在二人生死抉择的时候，师傅再一次变化。打败了师傅后，莫茗也受到了重创而奄奄一息。 没想到莫茗就这样死了。 而世界也和平了。 游戏结束