随着卵巢的周期性变化，生殖器其他部分也产生相应的周期性变化。其中以子宫内膜的变化最为显著。在卵巢周期中，当卵巢内有卵泡发育及成熟时，在卵巢激素的作用下，子宫内膜出现增生现象即增生期内膜；排卵后，在卵巢黄体分泌孕激素和雌激素的作用下，试增生的子宫内膜有分泌现象即分泌期内膜；卵巢黄体退化后，由于雌激素及孕激素量的减少，子宫内膜失去了支持出现坏死和剥落，表现月经来潮，此时称月经期内膜。
1.增生期； 经期后，在雌激素作用下，上皮细胞开始从内膜腺体的断端增生，向上覆盖子宫粘膜的表面，约在月经周期第5到9天时，子宫内膜很薄，腺体散在、稀疏、腺管狭窄而直，腺腔面平整。在月经周期10到14天，内膜增厚成波纹状，腺体及间质明显增生，腺体增多、变宽，并渐屈曲。血管也增生，渐呈螺旋状。间质则增生致密。 此期相当于卵泡发育成熟阶段，即月经周期的第5～14天左右。
分泌期； 约为月经周期的15～23天，相当于排卵后黄体成熟阶段黄体分泌的孕激素和雌激素，将使增生期内膜继续增厚，腺体进一步扩大、屈曲、出现分泌现象。血管也迅速增长，更加屈曲。间质变疏松并有水肿。此时内膜厚且松软，含有丰富营养物质，有利于受精卵着床发育。
月经前期； 相当于黄体退化阶段，约经期的24～28天。黄体退化时，孕激素、雌激素水平逐渐下降。激素的这一减退，将使内膜间质水肿消退变致密，致血管受挤压而使血流郁滞。最后轮番地出现局部血管的痉挛性收缩，造成内膜缺血、坏死，血管破裂出血。
月经期； 为月经周期第1～4天。在内膜功能层（在基底层以上的部分，厚约5～6mm形成的散在小血肿，将使坏死的内膜剥脱，随血液排出，称之为月经。内膜的基底层随即开始增生，形成新的内膜。故月经期实际上是一个周期的结束，也是下一周期的开始。
在子宫内膜的周期性变化过程中如若感染、雌激素过度刺激会导致子宫内膜增生。另外子宫内膜增生相关的因素主要包括经期同房，不洁性交或多伙伴性交、无排卵、多囊卵巢综合症、外源性雌激素的应用等。此外，研究还表明高学历、肥胖、糖尿病和激素替代疗法存在子宫内膜增生症高危因素的流行病学特征，尤其是激素替代疗法大大增加了子宫内膜增生的发病危险。