选择连锁总部失误 一些连锁者不全面仔细调查特许组织的经营状况，尤其忽略了向现有连锁店征询，而只是偏听总部的一面之词，被总部所描绘的美好蓝图所吸引，结果加入后陷入困境时后悔已晚；另一些连锁者只看到某个总部当时迅速发展的表象，不去考查总部的后续服务是否跟得上这种业务发展，结果也是一场空欢喜；还有些连锁者不去仔细推敲连锁合约的各个条款，被一些别有用心的总部钻了空子，到头来上当受骗，心血付诸东流。可以说，选择合适的连锁总部对连锁者来说是最关键的一步，在这上面多花些精力，将来在业务上就会多一份顺利，成功的机会也就相应增多。应该如何处理与防范这些问题？可以从以下几个方面注意：1、一定要认真考察总部的实力，最好能亲自到总部自己经营的直营店去考察；2、查阅总部已有连锁店，随机抽二到三家去实地考察；3、请专业律师对总部提供的连锁协议进行参考，然后才提出连锁事宜；4、如果总部自己的直营店经营数量没达到五家，最好不要去想连锁，这样的总部更多的目的是为了连锁圈钱。
缺乏连锁管理经验 开创一个事业，要想获得成功，产品的可行性占成功因素的40%，管理占30%，其余的30%是天时、地利、人和。即使是家小小的店铺，管理也是不可忽略的，许多连锁店之所以陷入经营困境，很大程度上是因为连锁者缺乏管理经验。一些连锁者以前是属于上班一族，在大企业中对某个小部门的业务管理了如指掌，但要主持一个事业，这点经验往往是不够的。例如，做过销售的人，可能对财务方面缺乏了解，在估计投资总额时，只考虑到开店所必需的项目开支，而对一些额外的开支如税务、意外、各项行政收费等忘得一干二净，对存货、现金流动等估计不足导致开业后捉襟见肘，十分艰难。还有一些连锁者，在连锁前已有事业，买一个特许经营权希望作多方面的发展，这一类投资者往往会犯同一个错误，即自以为是，把过去自己企业的独断专行作风带过来，认为自己有经营管理的经验，而忽略了整体纪律的重要性，这些都是缺乏管理经验的表现。人们常说“管理出效益”，这不是一句空话，伟大的管理学家德鲁克曾经说过：管理是所有组织所特有的独具特色的工具。因此，作为连锁者，选择连锁不仅仅是只对某一产品的独特性选择，而是在选择好产品的同时，还要选择总部的管理模式。对缺乏管理经验的连锁者来说如何避免这个问题？以下几个方面应该注意：1.连锁时要注意，总部是否能提供给连锁者足够时间到总部学习管理模式？2.该管理模式是否适合连锁者或者说连锁者是否能有效接受该管理模式；3.总部在传授给连锁者管理模式时，采用的是何种方式；4.对缺乏管理经验的连锁者来说，总部提供的前期的开业支持能持续多长时间，并能言传身教地带连锁者多少时间。
偏离连锁总部经营理念 连锁者与连锁总部之间的关系，是建立在互利双赢的基础上。而要达到互利，双方必须互相配合和协调。有人常将连锁体系当作一个大家庭来看待，家庭是否能够和乐融融，那要看家长的领导方式与观念，是不是能够受到家庭成员的重视与遵从。同样的道理，连锁体制是由来自各地的连锁店组合而成，每个人都有自己的想法、做法，不可能像直营系统那样凡事都是上令下行，执行的员工容易管控。所以，对于政策的执行，总部往往在观念沟通与凝聚各连锁店的共识上，得多花点功夫。
而连锁店对总部政策的看法，常常会有一个疑问：奇怪！做生意就做生意，总部动不动就来个计划，不但浪费我的时间，钱又没有多赚一点，而且不配合的话，还会被总部处罚，真是“劳民又伤财”！ 因此，在经营过程中，很多连锁店正是抱着这种观念， 不知不觉地偏离了总部的经营思路，结果导致经营不善。其实，总部的许多决策或经营思路，都是经过了长时间积累形成的宝贵经验，如果连锁者在经营过程中发现问题及时与总部进行沟通，并将相关情况通知总部，总部派人来指导并进行经营调整，完全可以避免发生此类事情。因此，双方要保持以下沟通： 1.连锁店要加强与总部的沟通，对总部下发的经营性文件，要及时执行，并及时反馈相关信息； 2.连锁店出现经营思路变化时，要及时与总部联系，请总部派人来进行调整，并请总部及时支持到与之相关的变化； 3.总部要保持与连锁店的沟通渠道的畅通无阻，随时了解连锁店经营状态，使连锁商保持赢利水平。
连锁总部后继服务不到位 总部对连锁店后续服务最重要的有三点：一是技术支持，二是后续培训，三是督导检查。 培训是连锁体系维系良好服务品质的重要法宝，但不少总部所规定的培训内容，连锁店不是不来上课就是不愿意配合，致使总部的培训意愿落空。于是，总部与连锁店之间，也会因此而争执。
不了解连锁体系的人，或许会有疑问：特许连锁不就是连锁店交了费用后，使用总部的品牌做生意，怎么会跟培训扯上关系呢？事实上，总部的经营理念、营运方式，以及日后的革新措施，如果没有透过培训来落实到众多连锁店的营运上，整个体系的步调与作风，恐怕会南辕北辙。 特许连锁体系的一大特色，就是总部会对旗下的连锁店与员工，进行经常性的培训。一般来说，总部除了初期的密集式培训外，还会随时针对新产品、新技术、新方法的采用，要求连锁店来上课，以便让连锁体系可以更顺利地按照新的经营方式运作下去。
在连锁店开始成功运作后，总部对连锁店的督导检查体系要跟进，不要放任连锁店自由管理，毕竟连锁店对总部的经营管理模式、经营理念、价值观等的执行程度如何，是直接关系到连锁店经营成功与否的关键所在。因此，总部必须时常对连锁店执行检查，同时总部新的产品开发后，要第一时间告诉连锁店，让连锁店派人前往学习培训。并且在督导检查过程中，也要同步不断地为连锁店员工进行培训，以至让连锁店完全执行复制总部成功的经验。要做到以下几个方面： 1、连锁店与总部要有约定，督导指导人员多久必须到连锁店进行检查指导工作，并要有详细的记录； 2、连锁店与总部要约定，对新产品、新持术的研发要及时通知连锁店，让连锁店派人去参加学习培训； 3、总部要给连锁店制定成长计划，并辅导连锁商实施成长计划。
最后慎重提醒连锁者们：投资有风险，请慎重选择。