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多糖多酚/复杂植物RNA提取方法及步骤

EASYspin无苯酚、氯仿RNA快速提取技术基础上,又独家研发成功基因组DNA清除柱技术可以有效清除gDNA残留,得到的RNA一般不需要DNase消化,可用于反转录PCR、荧光定量PCR等实验。独特的裂解液迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶, 离心沉淀去除多糖多酚和次级代谢产物,然后裂解混合物用乙醇调节RNA结合吸附到基因组DNA清除柱,然后RNA被选择性洗脱滤过, 吸附在基因组DNA清除柱上的残留DNA无法洗脱连同柱子一起丢弃从而清除掉DNA。滤过的RNA用乙醇调节结合条件后,RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的RNase free H20将纯净RNA从硅基质膜上洗脱。
工具/原料
1

EASYspin Plus多糖多酚/复杂植物RNA快速提取试剂盒1个

2

转速可以达到13,000 rpm的传统台式离心机

3

β-巯基乙醇,乙醇,研钵(可选)

方法/步骤
1

第一次使用前请先在漂洗液RW瓶加入指定量无水乙醇! 取1ml裂解液 CLB至离心管内(如果CLB有析出或者沉淀需先置于65°C水浴重新溶解),在裂解液CLB中加入5% β-巯基乙醇(1ml CLB加50μl β-巯基乙醇)。颠倒混匀后65°C水浴中预热。多个样品按照比例放大准备。1.          直接研磨法(实验室无液氮情况下或者柔软易研磨植物样品推荐此法):a.  新鲜植物组织或者冰冻保存样品称重后取100-200mg(水分少的样品如叶片种子等可加100-150mg,水分多的样品如草莓西瓜果实可多加一些)迅速剪成小块放入研钵,加入 1ml CLB(已加有β-巯基乙醇)室温下充分研磨成匀浆,注意应该迅速研磨让组织和裂解液CLB立刻充分接触以抑制RNA酶活性。β-巯基乙醇是裂解液CLB的关键成分,必要的时候可以提高终浓度到10-20%。如果特别复杂植物,可以尝试在裂解液中加入PVP40至终浓度2%。b.  将裂解物转入离心管,立即剧烈振荡15秒,短时放回 65°C水浴中(5-10 min),中间偶尔颠倒1-2次帮助裂解。13,000rpm离心10分钟,沉淀不能裂解的碎片。c.  取裂解物上清(在不超过基因组DNA清除柱能力的情况下可以取更多的上清,这样可以提高产量)转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇(0.5体积),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。若上清表面有漂浮物,用吸头挑开吸取下面液体即可。d.  立刻接操作步骤的步骤3。

2

液氮研磨法(适用广泛,提取复杂难破碎,易降解样品时推荐此法):a.  液氮中研磨新鲜或-70°C冷冻的材料至细粉。b.  转移100-200mg细粉(水分少的样品如叶片种子等可加100-150mg,水分多的样品如草莓西瓜果实可多加一些)加至预热的裂解液CLB(已加有β-巯基乙醇)离心管中。立即剧烈涡旋30-60秒或者用吸头吹打混匀裂解直得到满意匀浆结果(或者电动匀浆30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高产量。c.  短时放回 65°C水浴中(5-10 min),中间偶尔颠倒1-2次帮助裂解。d.  将裂解物13,000 rpm离心10分钟,沉淀不能裂解的碎片。e.  取裂解物上清(在不超过基因组DNA清除柱能力的情况下可以取更多的上清,这样可以提高产量)转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇(0.5体积),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。若上清表面有漂浮物,用吸头挑开吸取下面液体即可。f.  立刻接操作步骤的步骤3。

3

将混合物(每次小于720μl,多可以分两次加入)加入一个基因组清除柱中,(清除柱放入收集管中)13,000 rpm离心2分钟,弃掉废液。确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。

4

将基因组DNA清除柱子放在一个干净2ml离心管内(不用RNAse free 或者DEPC处理,一般干净的新离心管即可。也可使用RNA吸附柱配套的新的干净收集管),在基因组清除柱内加500μl裂解液RLT Plus,13,000 rpm离心30秒, 收集滤液(RNA在滤液中),用微量移液器较精确估计滤过液体积(通常为450-500μl左右,滤过时候损失体积应该减去),加入0.5倍体积的无水乙醇,此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。

5

立刻将混合物(每次小于720μl,多可以分两次加入)加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm离心2分钟,弃掉废液。确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。

6

加700μl 去蛋白液RW1,室温放置1分钟,13,000rpm 离心30秒,弃掉废液。

7

加入500μl漂洗液RW(请先检查是否已加入无水乙醇!),13,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。加入500μl漂洗液RW,重复一遍。

8

将吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

9

取出吸附柱RA,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50μl RNase free water(事先在 70-90℃水浴中加热可提高产量), 室温放置1分钟,12,000 rpm 离心1分钟。

10

如果预期RNA产量>30μg,加30-50μl RNase free water重复步骤9,合并两次洗液,或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍(如果需要RNA浓度高)。洗脱两遍的RNA洗脱液浓度高,分两次洗脱合并洗脱液的RNA产量比前者高15–30%,但是浓度要低,用户根据需要选择。

11

DNA酶柱上消化1.        按照前面所列操作步骤操作,直到做完操作步骤5。2.        取45μl DNase I buffer和5μl RNase free DNase I在离心管轻轻吹打混匀成工作液(处理多个离心柱子要按照比例放大制备工作液)。3.        向吸附柱RA 中加入350μl去蛋白液RW1,12,000 rpm 离心30 秒,弃废液,将吸附柱放回收集管中。4.        向吸附柱RA 中央加入50μl的DNase I 工作液,室温(20℃-30℃)放置15 分钟。注意直接将工作液滴在膜中央上向膜四周浸润充分和膜接触,不要让工作液滴在O型垫圈或是离心柱管壁上挂壁或者挂在垫圈上不能充分和膜接触。5.        向吸附柱RA 中加入350μl去蛋白液RW1, 12,000 rpm 离心30-60 秒,弃废液,将吸附柱放回收集管中。接操作步骤7完成后续步骤。

12

RNA含量少样品或者RNA复杂产量低的解决方案     可以提高样品处理量到300-500mg/2ml裂解液CLB,上清过两根基因组DNA清除柱子,洗脱下来的RNA,可以两个合并到一根RNA吸附柱上,可以大大提高RNA浓度。

注意事项
1

不合适的储存于低温(4℃或者-20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室温下(15℃-25℃)进行。

2

避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

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