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将all databases 改成nucleotide,如图所示
在空白处搜索你想要的基因序列名称,这里选择TH11(新型鸭呼肠孤病毒中的一种),弹出如下框所示界面,这里想要构建TH11的L1基因组序列的比对情况,所以继续下拖,选择TH11的L1区段全基因组序列,如下图所示。备注:这里也可以选择基因登陆号搜索你要的基因组序列,比如GenBank: JX826587.1)(新型鸭呼肠孤病毒中的一种)
完成上述步骤后,点击进入,弹出如下对话框,
完成上述步骤后,然后点击FASTA,弹出基因组序列。
按上述步骤依次找到其余你想要序列。这里选择了Muscovy duck reovirus strain J18 segment L1, complete sequence;KJ879924.1 Duck reovirus SD-12 segment L1, complete sequence;Duck reovirus strain 091 segment L1, complete sequence;Avian orthoreovirus strain S1133 segment L1, complete sequence;>KY418032.1 Muscovy duck reovirus strain MW9710 segment L1, complete sequence;这里也可以选择基因登陆号搜索你要的基因组序列
将你找到的基因序列如图所示,将其选中,然后在桌面新建一个txt文档,将其复制粘贴到txt文档里面,做好文档名称的标记New Roman';font-size:14px;mso-font-kerning:1px;' >1、按上述步骤依次找到其余你想要序列。这里选择了Muscovy duck reovirus strain J18 segment L1, complete sequence;KJ879924.1 Duck reovirus SD-12 segment L1, complete sequence;Duck reovirus strain 091 segment L1, complete sequence;Avian orthoreovirus strain S1133 segment L1, complete sequence;>KY418032.1 Muscovy duck reovirus strain MW9710 segment L1, complete sequence;
基因进化树构建至少需要4个基因组序列才能进行比对构建进化树