主成分分析(PCA)是排序分析(Ordination)的一种,常用于生态学领域。本文介绍如何用Past做主成分分析
工具/原料
Past软件
方法/步骤
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Multivariate菜单--Ordination--Principle Components (PCA)
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Summary选项卡列出了每个坐标轴的Eigenvalue值及其所占百分比。如果修改了运行参数,需要点击Recompute重新计算
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Scatter Plot选项卡给出了PCA图,右边有若干选项(例如是否显示样品标签)点击“Graph Setting”按钮可设置更多作图选项
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如图可增加图片的外边框,将坐标轴由中间位置改为在边框上。可选择多种图片格式(SVG是矢量图,最清晰),点击Picture按钮可保存图片。
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Scores选项卡显示样品点在PCA图上的坐标,点击Copy复制全部内容,可粘贴到excel中。
注意事项
本经验适用于Past 3.x,低版本Past的操作界面略有不同
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