原理：各种蛋白质分子上可能带有不同的电性，经过离子交换管柱，可依其分子带电性的差异而分离开来。下面以Abbkine实战经验来讲解：
工具/原料
1
仪器设备：塑料管柱
2
收集器-干净试管
3
浓缩用离心机 (低速5,000 rpm)
4
浓缩离心管
5
药品试剂：胶体
6
Buffer A-0
7
Buffer A-300 溶离液
8
Buffer A-500 溶离液
方法/步骤
1
将管柱架好，并将三向阀及软管等组合完成。
2
震荡DEAE Sephacel 胶体使的悬浮，小心倒入管柱中，让胶体慢慢沈降，在沈降过程中随时加入buffer A-0,勿使胶体干掉。
3
待胶体沈降完全后，高度应在15 cm 左右。胶柱以buffer A-0 一直流洗，流速快慢可以不考虑；连接好收集器，每试管收2.5 mL.离子交换法的胶体平衡极为重要，可测流出液的pH 或离子浓度，看是否与buffer A-0 相同，若不一样则需要再流洗的。
4
样本的添加方法同上述胶体过滤法，并启动部分收集器开始收集，当样本全部没入胶体后，再加入同体积buffer A-0.以buffer A-0 流洗50 mL 后，去除胶体上方的缓冲液，但勿使胶体干掉。
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然后依序以buffer A-300, buffer A-500 溶离的，每批次流洗各50 mL,注意更换浓度时，胶体上方勿残存上一种溶液。
6
收集后，进行蛋白质定量分析以及GUS 活性测定，结果作图。
7
收集GUS 活性区，并以 浓缩，记得要保留100 μL.
8
离子交换胶体以buffer A-0 洗过50 mL 后，收起来交回。