1、什么是“知识产权司法鉴定”?
“知识产权司法鉴定”是：根据技术专家对本领域公知技术及相关专业技术的了解，并运用必要的检测、化验、分析手段，对被侵权的技术和相关技术的特征是否相同或者等同进行认定;对技术转让合同标的是否成熟、实用，是否符合合同约定标准进行认定;对技术开发合同履行失败是否属于风险责任进行认定;对技术咨询、技术服务以及其他各种技术合同履行结果是否符合合同约定，或者有关法定标准进行认定;对技术秘密是否构成法定技术条件进行认定;对其他知识产权诉讼中的技术争议进行鉴定。在“知识产权司法鉴定”中明确提到“对被侵权的技术和相关技术的特征是否相同或者等同进行认定”，可见，代码之间是否存在复制关系、相同代码所占比例，是属于“知识产权司法鉴定”的范围。
2、什么是“计算机司法鉴定”?
“计算机司法鉴定”是：运用计算机理论和技术，对通过非法手段使计算机系统内数据的安全性、完整性或系统正常运行造成的危害行为及其程度等进行鉴定。可见，“计算机司法鉴定”并不涉及到比较代码之间是否存在复制关系、相同代码所占比例如何的问题。
3、怎么判断一个鉴定机构是否具有“知识产权司法鉴定”?
既然已经知道“计算机司法鉴定”与“知识产权司法鉴定”存在明显的区别，在委托进行软件商业秘密鉴定时，应当怎么判断一个鉴定机构是否具有“知识产权司法鉴定”?判断一个机构是具有“计算机司法鉴定”还是“知识产权司法鉴定”，从该鉴定机构的营业执照就可以看出，在营业范围中有明确注明可进行鉴定的范围。换句话说，根据营业执照上登记的鉴定范围就可以直观判断是否具有“知识产权司法鉴定”资质。
综上，在判断软件商业秘密鉴定资质时，一定要注意区分“计算机司法鉴定”和“知识产权司法鉴定”，由于二者存在明显的区分，因此在处理软件商业秘密案件中，我们需要的是具有“知识产权司法鉴定”出具的鉴定意见，仅仅具有“计算机司法鉴定”资质的机构，是不能进行同一性鉴定的，这是我们判断某一鉴定机构是否可以进行软件商业秘密鉴定非常重要的依据。