前面基本上都是ChemDraw的应用。ChemOffice的功能很强大,不只是那些。下面的经验就是ChemOffice的一些就高级的功能了。下面以预测巴豆醛的过渡态能量为例。
工具/原料
ChemOffice
方法/步骤
1
在Chem3D绘制巴豆醛的结构
2
执行能量最低计算。单击菜单栏的“Calculation”——“MM2”——“Minimize Energy”,弹出“Minimize Energy”对话框
3
在“Job”下拉列表中选择“Minimize Energy”然后点击“Run”,进行计算
4
在Output窗口显示的计算结果如下。由计算结果可知,巴豆醛的总能量为4.6330 kcal/mol注意:总能量与空间结构有关系,不同人画的计算结果一般不一样。
5
优化过渡态计算。单击菜单栏的“Calculation”——“GAMESS Interface”——“Optimize to Translation State ”,弹出“GAMESS Interface”对话框
6
在“Job”下拉列表中选择“Optimize to Translation State ”然后点击“Run”,进行计算。这一步计算非常耗时,请做好心理准备哦!
7
在Output窗口显示的计算结果如下。energy = -143391.717932 Kcal/Mol
注意事项
1
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2
这些预测与所选的半经验公式,空结构型都有很大关系。
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