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植物基因组下载

本经验主要介绍植物基因组信息的下载方法
工具/原料
1

浏览器

2

Phytozome网址

方法/步骤
1

登陆植物基因组Phytozome网站主页,并点击“LOG IN”

2

填入账号和密码信息,并点击“ SIGN IN”

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此时网页回到了主页面,点击“Download”

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选择“Phytozome (All versions)”

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此时跳转到新的标签页,一般选择最新的版本,点击黑色三角,展开此版本所含内容

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选择你想下载的物种,点击黑色三角,比如说拟南芥

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annotation和assembly两个文件夹里分别放着注释信息和基因组序列信息。可根据自己的需要下载。文件名字上很容易看出来是cds序列还是蛋白质序列等信息

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根据自己的需要,在相应文件左侧打钩,比如我选择了cds文件和gff文件

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点击左上角的“Download Selected Files”,即可弹出下载页面进行下载

注意事项
1

一定要有注册账号

2

不同的浏览器弹出下载的页面有所不同

3

小文件可以这样下载。如果过大,最好用Globus下载

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