分子模拟MS中甲烷水合物建模经验分享。
工具/原料
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电脑
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MS分子模拟
方法/步骤
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第一：采用smart方法进行几何优化，energy中选择CVFF力场
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第二：通过能量和收敛性的变化可判断优化是否完成。
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第三：优化完成后在dynamic中设置不同参数进行动力学模拟，NPT系综。
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第四：NOSE控温方法和Parrinello控压方法，设置完成后点击run运行。
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第五：通过设置好的Sets可以观察甲烷分子和水分子在晶胞内的分布情况。以此观察甲烷分子的逸出和聚集
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第六：水合物分解需要从外界吸收热量，当体系势能开始上升的时候，就说明水合物开始分解了，当上升到一个平台期后，说明水合物完全分解
注意事项
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构建分子模拟模型
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检查输入参数合理性
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