多语言展示
当前在线:1810今日阅读:27今日分享:41

进化树的构建方法

系统进化树又称为演化树,是表明被认为具有共同祖先的各物种间演化关系的树.在树中每个节点代表其各个分支的最近共同祖先,而节点的线段长度对应了其演化的距离。
工具/原料
1

电脑

2

MEGA软件

方法/步骤
1

在NCBI上搜索所需的目的序列,以Metallothionein(MT)为例。

2

将所需目的序列复制到Word上,形成如图格式。

3

下一步用MEGA7构建进化树。首先打开MEGA,然后点击Align,点击Edit/Build Alignment,然后在弹出的小框中选择Create a new alignment,点击OK,根据你的需求选择Protein或DNA,如果比对的是核酸则点击DNA,若是蛋白质则点Protein.在此以Protein为例。

4

点击Protein,出现如下第一张图所示,然后将目的序列粘贴,变成第二张图所示。

5

点击Date菜单中的Phylogentic Analysis点击Yes,然后在主菜单中点击Analysis,点击Phylogeny并选择第二个。点击YES,然后在弹出的框中点击compute

6

下图即为所构建的进化树。

推荐信息